吴孟超医学奖奖励委员会是奖项的决策和监督机构，由医学科技及相关领域具有较高学术造诣、良好社会声誉，并热心医学科技奖励事业的专家、学者组成。

奖励委员会主要履行以下职能：

(1) 审定吴孟超医学奖年度工作方案和评审细则；

(2) 审定评审委员会提出的拟授奖结果；

(3) 审议重大异议及撤销奖励事项；

(4) 指导和监督奖项提名、评审、公示及授奖工作；

(5) 研究决定奖项设置、制度建设及奖励工作中的其他重大事项。

奖励委员会依照《吴孟超医学奖奖励章程》和相关制度独立履行职责，保障奖励工作的规范性、公正性和权威性。